Руководит работой Правозащитного центра «Мемориал» избираемый членами Центра Совет. Совет избирает своего председателя и назначает исполнительного директора.
Черкасов Александр Владимирович — председатель Совета ПЦ, член Правления Международного историко-просветительского, благотворительного и правозащитного общества «Мемориал», сотрудник программы «Горячие точки», член Экспертного совета при Уполномоченном по правам человека в РФ, журналист.
Добровольская Анна Юрьевна — исполнительный директор.
ЧЛЕНЫ СОВЕТА ПРАВОЗАЩИТНОГО ЦЕНТРА МЕМОРИАЛ
Вахнина Людмила Всеволодовна — кандидат биологических наук, с конца 1980-х активист демократического движения, с 1994 года — активист движения против войны в Чечне, с 2003 года — координатор Группы общественных организаций «Лишний солдат».
Ганнушкина Светлана Алексеевна — математик, с конца 1980-х организует правовую и гуманитарную помощь беженцам, работает в «горячих точках» бывшего СССР и России. Руководитель программы «Миграция и Право», член Правления Международного историко-просветительского, правозащитного и благотворительного общества «Мемориал», председатель Комитета «Гражданское содействие», член Правительственной комиссии по миграционной политике.
Глушкова Татьяна Сергеевна — юрист ПЦ «Мемориал», сотрудница программы «Защита прав человека с использованием международных механизмов», член координационного совета Проекта правовой помощи трансгендерным людям, совета ЛГБТ-группы «Стимул».
Давидис Сергей Константинович — юрист, социолог, активный участник деятельности по защите свободы собраний и по поддержке политзаключенных с середины 2000-х. Координатор «Союза солидарности с политзаключенными», член Бюро ФКС Объединенного демократического движения «Солидарость», член ПК ФКС «Партии 5 декабря», руководитель программы «Поддержка преследуемых по политическим мотивам и защита гражданских активистов» ПЦ «Мемориал».
Макаров Алексей Алексеевич — член Совета НИПЦ Мемориал, член правления Московского Мемориала, сотрудник архива Международного Мемориала.
Малыхин Владимир Александрович — сотрудник программы «Горячие точки»
Орлов Олег Петрович — руководитель программы «Горячие точки», член Правления Международного историко-просветительского, правозащитного и благотворительного общества «Мемориал», с 1996 по 2011 год был председателем Совета ПЦ «Мемориал», член Экспертного совета при Уполномоченном по правам человека в РФ.
Охотин Григорий Никитич — журналист, независимый исследователь. Сооснователь правозащитного медиа-проекта ОВД-Инфо и проекта Data4Society — сообщества журналистов и программистов, занимающихся анализом и популяризацией общественно полезных данных. Член правления Международного историко-просветительского, правозащитного и благотворительного общества «Мемориал».
Рачинский Ян Збигневич — с конца 1980-х активист движения «Мемориал», с 1990 года участвовал в экспедициях в «горячие точки», работал в зоне вооруженного конфликта в Чеченской Республике, член Правления Международного историко-просветительского, правозащитного и благотворительного общества «Мемориал», сопредседатель Московского «Мемориала». В 1993–96 годах был председателем Совета ПЦ «Мемориал».
Черкасов Александр Владимирович — инженер-физик, журналист, председатель Совета ПЦ «Мемориал», член Правления Международного историко-просветительского, правозащитного и благотворительного общества «Мемориал», сотрудник программы «Горячие точки», член Экспертного совета при Уполномоченном по правам человека в РФ.